RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 NTAN1Q96AB6 310 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 CASQ1P31415 396 aa23.54■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 L1CAMP32004 1257 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa23.54■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 TEKT4Q8WW24 435 aa23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 SOBPA7XYQ1 873 aa23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.52■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.52■■□□□ 1.36
TSNARE1-208ENST00000524325 HAPLN3Q96S86 360 aa23.52■■□□□ 1.36
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TSNARE1-208ENST00000524325 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
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TSNARE1-208ENST00000524325 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR3DQ70Z44 454 aa23.51■■□□□ 1.35
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TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A14Q96JA4 679 aa23.51■■□□□ 1.35
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZMYM5Q9UJ78 669 aa23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX12Q9UMY4 172 aa23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.51■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 TACR2P21452 398 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 ADCY2Q08462 1091 aa23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TSNARE1-208ENST00000524325 VITQ6UXI7 678 aa23.5■■□□□ 1.35
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