RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 VPS52Q8N1B4 723 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ADAM32Q8TC27 787 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 URGCPQ8TCY9 931 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS4Q9BTZ2 278 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM62Q9BVG3 475 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAM107BQ9H098 131 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 DDIT4Q9NX09 232 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 SCN5AQ14524 2016 aa8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0A0MRY4 1105 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM72CH0Y354 149 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 AMHP03971 560 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 APRTP07741 180 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CLTBP09497 229 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MAGEA3P43357 314 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SLC18A1P54219 525 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MTM1Q13496 603 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA5AQ13591 1074 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MPP2Q14168 576 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PDK1Q15118 436 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 QPCTQ16769 361 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SYCP2LQ5T4T6 812 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM72AQ5TYM5 149 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM72DQ6L9T8 149 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM72BQ86X60 149 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC39Q96DD0 335 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA13Q96N96 652 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PAFAH2Q99487 392 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 KCNK9Q9NPC2 374 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 RAD54BQ9Y620 910 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TNFRSF10BO14763 440 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 21
PDE4D-208ENST00000502484 AVILO75366 819 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OAZ2O95190 189 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV3-25P01717 112 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SELPP16109 830 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FDFT1P37268 417 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF534Q76KX8 674 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 EDEM1Q92611 657 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 CYTH2Q99418 400 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LGMNQ99538 433 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 WDCPQ9H6R7 721 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 OPHN1O60890 802 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ERCC2P18074 760 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 KRT15P19012 456 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 IFNAR2P48551 515 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TPI1P60174 286 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC14Q15048 493 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 MICALCLQ6ZW33 695 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TAC4Q86UU9 113 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD42Q8N9B4 389 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SCAMP5Q8TAC9 235 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 DYDC1Q8WWB3 177 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 P2RY11Q96G91 374 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 SGSM3Q96HU1 749 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 HIPK3Q9H422 1215 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 TRABDQ9H4I3 376 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-208ENST00000502484 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.45□□□□□ -1.06
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