RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KAT7O95251 611 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SETSIPP0DME0 302 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS6KB1P23443 525 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTGER1P34995 402 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS13P62277 151 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STIM1Q13586 685 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STARD3Q14849 445 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR162Q16538 588 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PXDC1Q5TGL8 231 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRABD2AQ86V40 505 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIGKQ92643 395 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF521Q96K83 1311 aa5.2□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087WV62 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX2-8O15522 239 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FFAR2O15552 330 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNPH1O43598 174 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASNA1O43681 348 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTN1O95631 604 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGBP02675 491 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENO1P06733 434 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRF1P14222 555 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST6GAL1P15907 406 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC8A1P32418 973 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NR4A2P43354 598 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ID2Q02363 134 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTA1Q13330 715 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTK2BQ14289 1009 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPARCL1Q14515 664 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AAK1Q2M2I8 961 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL22Q53GT1 634 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE1EQ5T753 118 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SHC4Q6S5L8 630 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STYXQ8WUJ0 223 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OBP2BQ9NPH6 170 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD63P08962 238 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CPA2P48052 419 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBFBQ13951 182 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NRACQ8N912 160 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM71BQ8TC56 605 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMM1Q92871 262 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR78Q96P69 363 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCNM1Q9BWG6 230 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LGALS16A8MUM7 142 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP6R2O75170 966 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF6BO95407 300 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGPL1O95470 568 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXL2P58012 376 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL15P61313 204 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PFKFB4Q16877 469 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM60Q495X7 471 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RINT1Q6NUQ1 792 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GGT6Q6P531 493 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UEVLDQ8IX04 471 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXD3Q8N9H8 876 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF527Q8NB42 609 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RSC1A1Q92681 617 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EID2BQ96D98 161 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAR2Q96K12 515 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HEY2Q9UBP5 337 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A18PA6NE21 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A16PA6NEW6 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEPDP12955 493 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGFBP2P18065 325 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms