RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R50P59544 299 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 GPC5P78333 572 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PSG6Q00889 435 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CFHR3Q02985 330 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA4Q92187 359 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ARRDC3Q96B67 414 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ABHD10Q9NUJ1 306 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SYBUQ9NX95 663 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 VPS4AQ9UN37 437 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 GDAQ9Y2T3 454 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF213O14771 459 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 KLK10O43240 276 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 GALNSP34059 522 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 NR1H2P55055 460 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PCID2Q5JVF3 399 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LIPMQ5VYY2 423 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D5Q92609 795 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RMI1Q9H9A7 625 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FZD4Q9ULV1 537 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00473A8K010 186 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 GUCY1B2O75343 617 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1A3P13637 1013 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 MPLP40238 635 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CCT8P50990 548 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RAE1P78406 368 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 BAK1Q16611 211 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LINS1Q8NG48 757 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RFFLQ8WZ73 363 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 STAMQ92783 540 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF2O60811 474 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 BAIAP3O94812 1187 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CSF1P09603 554 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8FQ08AF8 430 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GPR162Q16538 588 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FAM153CQ494X1 144 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC24Q50LG9 513 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 Q6YL49 198 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 RCE1Q9Y256 329 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 IGFBP2P18065 325 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FPR3P25089 353 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ITPKBP27987 946 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SLC8A1P32418 973 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 GPR68Q15743 365 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 MMRN2Q9H8L6 949 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SCINQ9Y6U3 715 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 COL4A3Q01955 1670 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 PEX12O00623 359 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 PDE8BO95263 885 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ACP5P13686 325 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 BDNFP23560 247 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CASP6P55212 293 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CNGA3Q16281 694 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 LAS2Q8IYD9 372 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 TERB1Q8NA31 727 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC4CQ8WTT0 213 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 ZUFSPQ96AP4 578 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRC-212ENST00000491302 RNF125Q96EQ8 232 aa8.5□□□□□ -1.05
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