RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SHC2P98077 582 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 WDR45BQ5MNZ6 344 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 PIK3R6Q5UE93 754 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CHST9Q7L1S5 443 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 AHI1Q8N157 1196 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FAM81BQ96LP2 452 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GGA2Q9UJY4 613 aa23.51■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TBL1XO60907 577 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FYNP06241 537 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GNSP15586 552 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TPMTP51580 245 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DENND1BQ6P3S1 775 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 HDDC3Q8N4P3 179 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 STK32AQ8WU08 396 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF606Q8WXB4 792 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FAM149B1Q96BN6 582 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SERPINB11Q96P15 392 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TRIM62Q9BVG3 475 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SLC32A1Q9H598 525 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FSCN3Q9NQT6 498 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SUSD2Q9UGT4 822 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.5■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGAP33O14559 1287 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SYPP08247 313 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SGSHP51688 502 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 COPAP53621 1224 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MEA1Q16626 185 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CADM4Q8NFZ8 388 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 NUP58Q9BVL2 599 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GPR174Q9BXC1 333 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM245Q9H330 911 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 KCNJ18B7U540 433 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CAPN9O14815 690 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 HLA-EP13747 358 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SLC6A4P31645 630 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 NNTQ13423 1086 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 PLEKHG6Q3KR16 790 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MBLAC2Q68D91 279 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 BEND5Q7L4P6 421 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DEFB124Q8NES8 71 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 OR2T3Q8NH03 318 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MED15Q96RN5 788 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 EPG5Q9HCE0 2579 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 THAP12O43422 761 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 OPHN1O60890 802 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 IGLV3-19P01714 112 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DLDP09622 509 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MAOBP27338 520 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GNA15P30679 374 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 USP8P40818 1118 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GBP6Q6ZN66 633 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 TMEM110Q86TL2 294 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MLKLQ8NB16 471 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 DNASE2BQ8WZ79 361 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 STIM2Q9P246 746 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CHD8Q9HCK8 2581 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MEI4A8MW99 385 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 UPK3BL1B0FP48 263 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 UPK3BL2E5RIL1 263 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SLC9A1P19634 815 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CD70P32970 193 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SEMA3BQ13214 749 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 PTPRNQ16849 979 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 NADSYN1Q6IA69 706 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 GJB7Q6PEY0 223 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CACUL1Q86Y37 369 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MFN1Q8IWA4 741 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 FIBINQ8TAL6 211 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPN4-211ENST00000488279 ADAM32Q8TC27 787 aa23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms