RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 NME3Q13232 169 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 NAA35Q5VZE5 725 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 OLFML1Q6UWY5 402 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM92Q6UXU6 159 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 CHSY1Q86X52 802 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 MFN1Q8IWA4 741 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
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CCZ1B-211ENST00000486840 ELOVL2Q9NXB9 296 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 USP18Q9UMW8 372 aa27.83■■■□□ 2.05
CCZ1B-211ENST00000486840 F5H5T6 163 aa27.82■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 KIAA2013Q8IYS2 634 aa27.82■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC39A13Q96H72 371 aa27.82■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA8SH3BPF8 625 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 M0QYT0 321 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAM23O75077 832 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 F9P00740 461 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXC13P31276 330 aa27.81■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 CDH18Q13634 790 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 RASSF3Q86WH2 238 aa27.81■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 AHI1Q8N157 1196 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 CARNMT1Q8N4J0 409 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 LOXL4Q96JB6 756 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa27.81■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 FANCMQ8IYD8 2048 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ANTXRLA6NF34 631 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNU1A8MYU2 1149 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 H0Y626 953 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 EPHB6O15197 1021 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 MOCS3O95396 460 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 NSFP46459 744 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 GABRB2P47870 512 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ABCB8Q9NUT2 735 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 GGA2Q9UJY4 613 aa27.8■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 STON1Q9Y6Q2 735 aa27.8■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 TACR2P21452 398 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC6A4P31645 630 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SULT1E1P49888 294 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 MS4A13Q5J8X5 152 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 RAP1GAP2Q684P5 730 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 CHST9Q7L1S5 443 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 KBTBD6Q86V97 674 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ACOX2Q99424 681 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 HSD3B7Q9H2F3 369 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 INVSQ9Y283 1065 aa27.79■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM170AA1A519 330 aa27.78■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 NOMO3P69849 1222 aa27.78■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 GABRG3Q99928 467 aa27.78■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 WDCPQ9H6R7 721 aa27.78■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 LRP3O75074 770 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 IGLV3-25P01717 112 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 ST8SIA6P61647 398 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 DEUP1Q05D60 604 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 SPEM2Q0P670 501 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 XYLT1Q86Y38 959 aa27.77■■■□□ 2.04
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP1R9BQ96SB3 815 aa27.77■■■□□ 2.04
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CCZ1B-211ENST00000486840 TEX33O43247 280 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF217O75362 1048 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 DESP17661 470 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 HLA-FP30511 346 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS24P62847 133 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 CFAP52Q8N1V2 620 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 FIBINQ8TAL6 211 aa27.76■■■□□ 2.03
CCZ1B-211ENST00000486840 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
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