RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIAS2O75928 621 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP1P28562 367 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAD2Q05329 585 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 PGM5Q15124 567 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q5PR19 223 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 DENND1CQ8IV53 801 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf44Q8N8P7 122 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAB2Q9UQC2 676 aa3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CACNA2D1-211ENST00000486539 EMSYQ7Z589 1322 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 INAFM1C9JVW0 142 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM227AF5H4B4 570 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNX2O60749 519 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM225BP0DP42 221 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 EN2P19622 333 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS41P49754 854 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPAP53621 1224 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP12AP54707 1039 aa3.27□□□□□ -1.89
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGEF7Q14155 803 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SDE2Q6IQ49 451 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR56A3Q8NH54 315 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GJA10Q969M2 543 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 UHRF2Q96PU4 802 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PKP4Q99569 1192 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DONSONQ9NYP3 566 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 UTS2RQ9UKP6 389 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 FZD10Q9ULW2 581 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFS1Q9Y697 457 aa3.27□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 COL15A1P39059 1388 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 AQP7P3A6NL99 342 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 H7C4K7 107 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRYO14603 147 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RGS14O43566 566 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 EDIL3O43854 480 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 VCAM1P19320 739 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBL1P28749 1068 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPS2Q13227 327 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRHL2Q6ISB3 625 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 HPS3Q969F9 1004 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP3K14Q99558 947 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAP30LQ9HAJ7 183 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAP2Q9UGK3 403 aa3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1W2PPL8 197 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DPPA5A6NC42 116 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 LMX1BO60663 402 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL33O95760 270 aa3.25□□□□□ -1.89
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 AKR1A1P14550 325 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF84P51523 738 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 DGKQP52824 942 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 STPG1Q5TH74 334 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIPMQ5VYY2 423 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MZT2AQ6P582 158 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 Q6ZTK2 550 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 P3H2Q8IVL5 708 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM47BQ8NA70 645 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAML1Q92585 1016 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 VPS51Q9UID3 782 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 LAMP3Q9UQV4 416 aa3.25□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 EXTL3O43909 919 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 KATNA1O75449 491 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYP1A2P05177 515 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MATN1P21941 496 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFS1P28331 727 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABATP80404 500 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC39A14Q15043 492 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATAT1Q5SQI0 421 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 SUSD1Q6UWL2 747 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CACNA2D1-211ENST00000486539 MICU3Q86XE3 530 aa3.24□□□□□ -1.89
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