RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 HESX1Q9UBX0 185 aa13.18□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PSMA7O14818 248 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 EPHX1P07099 455 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 NCAM1P13591 858 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 HLA-FP30511 346 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R2P41236 205 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 FMO5P49326 533 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 STX17P56962 302 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DAOAP59103 153 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PAK1Q13153 545 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PMF1Q6P1K2 205 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TMEM270Q6UE05 265 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RNF214Q8ND24 703 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RNF139Q8WU17 664 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 UCMAQ8WVF2 138 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 GATA6Q92908 595 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SIPA1Q96FS4 1042 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RWDD2AQ9UIY3 292 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 KLK13Q9UKR3 277 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa13.17□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MEI4A8MW99 385 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SH3BP5O60239 455 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 GJB3O75712 270 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SYPP08247 313 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SETSIPP0DME0 302 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 LRRC63Q05C16 580 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 GRIK2Q13002 908 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 NCAPHQ15003 741 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MPPE1Q53F39 396 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DCAF12L1Q5VU92 463 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TTI2Q6NXR4 508 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 CHST9Q7L1S5 443 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RRAGAQ7L523 313 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 LUZP1Q86V48 1076 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF19Q8IW93 802 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 LMO3Q8TAP4 145 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SLC35F5Q8WV83 523 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 KCTD13Q8WZ19 329 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 FOXJ1Q92949 421 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MYEOVQ96EZ4 313 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 IL21RQ9HBE5 538 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ABCC13Q9NSE7 274 aa13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 M0QYV0 167 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 NPC1O15118 1278 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 SLC6A4P31645 630 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 CD70P32970 193 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 BNC1Q01954 994 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MYL5Q02045 173 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ARID5AQ03989 594 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ADGRF1Q5T601 910 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 ADIPOR2Q86V24 386 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 PPM1KQ8N3J5 372 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 DNASE2BQ8WZ79 361 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 NT5C1BQ96P26 610 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MIS12Q9H081 205 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TMEM245Q9H330 911 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 MTG2Q9H4K7 406 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 CNGB3Q9NQW8 809 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 GGA2Q9UJY4 613 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
PRAME-212ENST00000485532 TMEM131Q92545 1883 aa13.14□□□□□ -0.31
PRAME-212ENST00000485532 METTL12A8MUP2 240 aa13.14□□□□□ -0.31
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