RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FOXQ1	Q9C009	403 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SIK2	Q9H0K1	926 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	STIM2	Q9P246	746 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NCAM2	O15394	837 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TBL1X	O60907	577 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PAGE1	O75459	146 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFA10	O95299	355 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	FECH	P22830	423 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	OPRD1	P41143	372 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	HDAC4	P56524	1084 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	KDSR	Q06136	332 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	BTBD6	Q96KE9	485 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PNKP	Q96T60	521 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM7	Q9C029	511 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	MYO1F	O00160	1098 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	GPR37L1	O60883	481 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TULP3	O75386	442 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	LCA5L	O95447	670 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	APOD	P05090	189 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	DRD1	P21728	446 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	ADRA1B	P35368	520 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	GGCX	P38435	758 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	DGKG	P49619	791 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SGSH	P51688	502 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	LRRC31	Q6UY01	552 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	FBXL6	Q8N531	539 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PJA1	Q8NG27	643 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	HAPLN3	Q96S86	360 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NRDC	O43847	1150 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	CACNG3	O60359	315 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SRGAP2	O75044	1071 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	CLCN5	P51795	746 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RBM34-208	ENST00000485019	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3

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