RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PALM2Q8IXS6 379 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 EXTL1Q92935 676 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 Q96MF0 132 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 C8orf49Q96NF6 230 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa5.14□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 K7ENM7 598 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SPTLC2O15270 562 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TIMM44O43615 452 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 URI1O94763 535 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 NR2F6P10588 404 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP24386 653 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ITPKBP27987 946 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP1P28562 367 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DIO1P49895 249 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CCR9P51686 369 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT32Q14532 448 aa5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD11Q8NFV4 315 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 HAS1Q92839 578 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 APOPT1Q96IL0 206 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TAOK3Q9H2K8 898 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DUSP22Q9NRW4 184 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CNPY2Q9Y2B0 182 aa5.13□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 PLSCR1O15162 318 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 USO1O60763 962 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PRAMEF2O60811 474 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBED4O75132 1171 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TULP3O75386 442 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 NPSP0C0P6 89 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 WEE2P0C1S8 567 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PEPDP12955 493 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 HOXA5P20719 270 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 GPD2P43304 727 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 GPC5P78333 572 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PSG6Q00889 435 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 LMAN2Q12907 356 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 NFIL3Q16649 462 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 RUNDC3AQ59EK9 446 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 BRINP3Q76B58 766 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC89Q8N998 374 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.12□□□□□ -1.59
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RABGGTB-207ENST00000470201 CLPBQ9H078 707 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 IL21RQ9HBE5 538 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 USP29Q9HBJ7 922 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 ABHD10Q9NUJ1 306 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGGTB-207ENST00000470201 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.12□□□□□ -1.59
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