RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457749.6

ZNF28-204, Transcript of zinc finger protein 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF28, Length 4,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28-204ENST00000457749 C3orf20Q8ND61 904 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 GANCQ8TET4 914 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 DDI1Q8WTU0 396 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KRT12Q99456 494 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CNPY3Q9BT09 278 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 LHX5Q9H2C1 402 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TASP1Q9H6P5 420 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 VRTNQ9H8Y1 702 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MARCH2Q9P0N8 246 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CDC23Q9UJX2 597 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 USP18Q9UMW8 372 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TRIM66O15016 1216 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 HSF2BPO75031 334 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KRT7P08729 469 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RARGP13631 454 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TIE1P35590 1138 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ARHGAP25P42331 645 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SIGLEC14Q08ET2 396 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 INCA1Q0VD86 236 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 HECTD3Q5T447 861 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 EMC10Q5UCC4 262 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ANO7Q6IWH7 933 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 AADACL2Q6P093 401 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TXNDC11Q6PKC3 985 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 VSTM1Q6UX27 236 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 VITQ6UXI7 678 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MTSS1LQ765P7 747 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CEP112Q8N8E3 955 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 LRRN4Q8WUT4 740 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 FAM3CQ92520 227 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KRT35Q92764 455 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CHFRQ96EP1 664 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ASB16Q96NS5 453 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 LRRC3BQ96PB8 259 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 LAMTOR5O43504 91 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 FBXO21O94952 628 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MIPP30301 263 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SLC7A5Q01650 507 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KCNC3Q14003 757 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 BBS2Q9BXC9 721 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CYTH4Q9UIA0 394 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 INTUQ9ULD6 942 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 NUMA1Q14980 2115 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 NLRC5Q86WI3 1866 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MYOFQ9NZM1 2061 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 E7EVH7 732 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SGK1O00141 431 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 PROSCO94903 275 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 PAX3P23760 479 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 AVPR2P30518 371 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 KCNJ1P48048 391 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 C2orf54Q08AI8 447 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 HTR4Q13639 388 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 POTEHQ6S545 545 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CEP68Q76N32 757 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 MON1AQ86VX9 555 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CHSY1Q86X52 802 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 XYLT1Q86Y38 959 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CHPFQ8IZ52 775 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 CCDC89Q8N998 374 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TMEM174Q8WUU8 243 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 RLN3Q8WXF3 142 aa4.89□□□□□ -1.63
ZNF28-204ENST00000457749 TBCBQ99426 244 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms