RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP8P85298 464 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TYRO3Q06418 890 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF234Q14588 700 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLA2G2CQ5R387 149 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPP7Q5T2T1 576 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAF3Q5VWG9 929 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF43Q68DV7 783 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYEOVQ96EZ4 313 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMOC1Q9H4F8 434 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNCQ9H7C4 482 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DLL3Q9NYJ7 618 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STIM2Q9P246 746 aa16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAH14Q0VDD8 3507 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM170AA1A519 330 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHB6O15197 1021 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF806P0C7X5 589 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF18P17022 549 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX16P57768 344 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK17Q00537 523 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CREB5Q02930 508 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENPP2Q13822 863 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCAPHQ15003 741 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHST9Q7L1S5 443 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GGA2Q9UJY4 613 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THADAQ6YHU6 1953 aa16.15■□□□□ 0.18
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LGALS16A8MUM7 142 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP3K13O43283 966 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIMM44O43615 452 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GDF9O60383 454 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAB1O75553 588 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMEP08473 750 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKCHP24723 683 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD70P32970 193 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS24P62847 133 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC6A3Q01959 620 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARID5AQ03989 594 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STARD3Q14849 445 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 E2F5Q15329 346 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYCP1Q15431 976 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FUT11Q495W5 492 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADIPOR2Q86V24 386 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHSY1Q86X52 802 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MFN1Q8IWA4 741 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AHI1Q8N157 1196 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFAP52Q8N1V2 620 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BTN2A3PQ96KV6 586 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRGPRX1Q96LB2 322 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NLRC4Q9NPP4 1024 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VPS45Q9NRW7 570 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDIT4Q9NX09 232 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COX16Q9P0S2 106 aa16.14■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms