RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415569.5

GTDC1-208, Transcript of glycosyltransferase like domain containing 1, human

TSL 5

Gene GTDC1, Length 2,780 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTDC1-208	ENST00000415569	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569		A6NNZ2	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KCNN4	O15554	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	METTL18	O95568	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TSHR	P16473	764 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	FGFR3	P22607	806 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	GLUD2	P49448	558 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	STAT4	Q14765	748 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	MTFR1	Q15390	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HIF1A	Q16665	826 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ADAM32	Q8TC27	787 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	EPN3	Q9H201	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	PAK5	Q9P286	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	OBSL1	O75147	1896 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ERICH4	A6NGS2	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569		E7EVH7	732 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569		H7C0C1	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	SYN3	O14994	580 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TPSB2	P20231	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HOXC13	P31276	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ATP5O	P48047	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	SLC5A3	P53794	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TPSAB1	Q15661	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CENPU	Q71F23	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	NPW	Q8N729	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	MCU	Q8NE86	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	URGCP	Q8TCY9	931 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	NMUR1	Q9HB89	426 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	OSER1	Q9NX31	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
GTDC1-208	ENST00000415569	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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