RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 STON1Q9Y6Q2 735 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP205Q92621 2012 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 BCKDHBP21953 392 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP8P85298 464 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC6A3Q01959 620 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PMS2CLQ68D20 193 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 OR6B2Q6IFH4 312 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1211LQ6NV74 962 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 TBL1XO60907 577 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 APOEP02649 317 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 IL12RB1P42701 662 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CDK17Q00537 523 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 EPS8L1Q8TE68 723 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 RLN3Q8WXF3 142 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SPACA7Q96KW9 195 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CIPCQ9C0C6 399 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SYNCQ9H7C4 482 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 RAD54BQ9Y620 910 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 LGALS16A8MUM7 142 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 GRAP2O75791 330 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF806P0C7X5 589 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 GABRB2P47870 512 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 JAM2P57087 298 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF234Q14588 700 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF3Q5VWG9 929 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 WFDC5Q8TCV5 224 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CKAP5Q14008 2032 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CACNA1AO00555 2505 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 EPHB6O15197 1021 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 LSM8O95777 96 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NDUFV2P19404 249 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SDHBP21912 280 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NOS2P35228 1153 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MPLP40238 635 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 STARD3Q14849 445 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SYCP1Q15431 976 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 CHST9Q7L1S5 443 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF677Q86XU0 584 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 AHI1Q8N157 1196 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 FRMD1Q8N878 549 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 FIBINQ8TAL6 211 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 C18orf8Q96DM3 657 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MRGPRX1Q96LB2 322 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DDIT4Q9NX09 232 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 GGA2Q9UJY4 613 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 DAB1O75553 588 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 GFPT2O94808 682 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 MMEP08473 750 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC2A3P11169 496 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms