RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCML2Q9UQR0 700 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF3AQ9Y496 699 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 U3KQA8 63 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1B0GVM2 712 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A1W2PPC4 97 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RRP8O43159 456 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLK10O43240 276 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFSO43281 561 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC26A4O43511 780 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIGLEC6O43699 453 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIN3BO75182 1162 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 STAU1O95793 577 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ITGAVP06756 1048 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACADMP11310 421 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 C6P13671 934 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GAP43P17677 238 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCP2P22307 547 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC6A4P31645 630 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 HNF1BP35680 557 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 LONP1P36776 959 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF11P52732 1056 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NXPH1P58417 271 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABREP78334 506 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNC4Q03721 635 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCOA4Q13772 614 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TEAD4Q15561 434 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF699Q32M78 642 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKDCCQ504Y2 493 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC25A45Q8N413 288 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PDILTQ8N807 584 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RFFLQ8WZ73 363 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 BAP1Q92560 729 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOCQ99972 504 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTBD1Q9H0C5 482 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NEUROG2Q9H2A3 272 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCB8Q9NUT2 735 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 EHD2Q9NZN4 543 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SEL1LQ9UBV2 794 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK17AQ9UEE5 414 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DACH1Q9UI36 760 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOC7Q9UPT5 735 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CENPEQ02224 2701 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOTCH2Q04721 2471 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC12A8A0AV02 714 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TTC34A8MYJ7 566 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 TERTO14746 1132 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAPN9O14815 690 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FFAR2O15552 330 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABBR2O75899 941 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MT-CO3P00414 261 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM200BP0CF97 657 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCB4P21439 1286 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 DRD3P35462 400 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLA2G4AP47712 749 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PSMD8P48556 350 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCAT1P54687 386 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADPRHP54922 357 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 C21orf59P57076 290 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFATC3Q12968 1075 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 E2F4Q16254 413 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00303Q3SY05 128 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF667Q5HYK9 610 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBLAC2Q68D91 279 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NADSYN1Q6IA69 706 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLHDC10Q6PID8 442 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU6-171P-201ENST00000384354 SV2BQ7L1I2 683 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms