RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ERICH1Q86X53 443 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC20A1Q8WUM9 679 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 C18orf8Q96DM3 657 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM204AQ9H8W3 233 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NUMA1Q14980 2115 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM170AA1A519 330 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TBL1XO60907 577 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CDR2Q01850 454 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 IQCB1Q15051 598 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 MPP7Q5T2T1 576 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF43Q68DV7 783 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SDE2Q6IQ49 451 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 DDIT4Q9NX09 232 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CHD5Q8TDI0 1954 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TEX33O43247 280 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RETP07949 1114 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CHRNB2P17787 502 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 HLA-FP30511 346 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NOS2P35228 1153 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SCNN1AP37088 669 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FMO1Q01740 532 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NAA35Q5VZE5 725 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM215Q68D42 235 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 KBTBD6Q86V97 674 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 XYLT1Q86Y38 959 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 MSANTD4Q8NCY6 345 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 UCMAQ8WVF2 138 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 HMGB4Q8WW32 186 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CPA5Q8WXQ8 436 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 MYEOVQ96EZ4 313 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 BTN2A3PQ96KV6 586 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 GABRG3Q99928 467 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ELOVL2Q9NXB9 296 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1W2PQF6 199 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 WASH3PC4AMC7 463 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 DCLK1O15075 740 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 GBP1P32455 592 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 MATKP42679 507 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS24P62847 133 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 C2CD6Q53TS8 623 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA1211LQ6NV74 962 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA2013Q8IYS2 634 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 OLIG1Q8TAK6 271 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 WFDC5Q8TCV5 224 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CD248Q9HCU0 757 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ABCB8Q9NUT2 735 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 COX16Q9P0S2 106 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 STIM2Q9P246 746 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 INVSQ9Y283 1065 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 STON1Q9Y6Q2 735 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNU1A8MYU2 1149 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NPC1O15118 1278 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC2A3P11169 496 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 GABRG2P18507 467 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TACR2P21452 398 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CCR1P32246 355 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ENPP2Q13822 863 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF234Q14588 700 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 PLK5Q496M5 336 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FILIP1LQ4L180 1135 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RAP1GAP2Q684P5 730 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 TRIM72Q6ZMU5 477 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CHSY1Q86X52 802 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 LGI2Q8N0V4 545 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 PGBD3Q8N328 593 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF34Q969K3 372 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 NPY6RQ99463 290 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 CIPCQ9C0C6 399 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP5-201ENST00000366391 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms