RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 NETO1Q8TDF5 533 aa7.97□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 NOX5Q96PH1 765 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 GABRG3Q99928 467 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 CIPCQ9C0C6 399 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 VPS45Q9NRW7 570 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.97□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 RAD54BQ9Y620 910 aa7.97□□□□□ -1.13
SGMS1-201ENST00000361543 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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SGMS1-201ENST00000361543 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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SGMS1-201ENST00000361543 IL12RB1P42701 662 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 SNX16P57768 344 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFB4P59827 614 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ARID5AQ03989 594 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 KCNMA1Q12791 1236 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ENPP2Q13822 863 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF234Q14588 700 aa7.95□□□□□ -1.14
SGMS1-201ENST00000361543 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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