RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD70P32970 193 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACADSBP45954 432 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 COPAP53621 1224 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MEA1Q16626 185 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAN2A1Q16706 1144 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHST9Q7L1S5 443 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM110Q86TL2 294 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYT12Q8IV01 421 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK32AQ8WU08 396 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC39A13Q96H72 371 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 STIM2Q9P246 746 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 GGA2Q9UJY4 613 aa23.63■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNJ18B7U540 433 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 AP5Z1O43299 807 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC11A2P49281 568 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPS24P62847 133 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF33AQ06730 810 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 STARD3Q14849 445 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 HSPA12BQ96MM6 686 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPINB11Q96P15 392 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CPXM1Q96SM3 734 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNAJC12Q9UKB3 198 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TLR6Q9Y2C9 796 aa23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF217O75362 1048 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPHX1P07099 455 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF445P59923 1031 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPRNQ16849 979 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPDYCQ5MJ68 293 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMLNQ96KR4 655 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NDST4Q9H3R1 872 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM170AA1A519 330 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NPC1O15118 1278 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SART1O43290 800 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGLV3-25P01717 112 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLCN1P35523 988 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 VWA3BQ502W6 1294 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MBLAC2Q68D91 279 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMPRSS6Q8IU80 811 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM245Q9H330 911 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM9BQ9NQ34 198 aa23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CAPN9O14815 690 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 GIPC1O14908 333 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRAK2O43187 625 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFIP05156 583 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ENGP17813 658 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAPK8P45983 427 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARID5AQ03989 594 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNMA1Q12791 1236 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 NNTQ13423 1086 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 AHI1Q8N157 1196 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 AZIN2Q96A70 460 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM81BQ96LP2 452 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MTG2Q9H4K7 406 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRAP2O75791 330 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNK5O95279 499 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 ERBB2P04626 1255 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAOBP27338 520 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 TPMTP51580 245 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 LMAN2Q12907 356 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 FSCBQ5H9T9 825 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MS4A13Q5J8X5 152 aa23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25-201ENST00000348333 MPP7Q5T2T1 576 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms