RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DUSP4Q13115 394 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LLGL1Q15334 1064 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PPP2R5EQ16537 467 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BOLA3Q53S33 107 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RASIP1Q5U651 963 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C8orf74Q6P047 294 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GPR152Q8TDT2 470 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 EDEM1Q92611 657 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZBP1Q9H171 429 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RRN3Q9NYV6 651 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 IL37Q9NZH6 218 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LCHNA4D1U4 455 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 M0QYT0 321 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MDM4O15151 490 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ABLIM3O94929 683 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KRT10P13645 584 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 USP46P62068 366 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CREMQ03060 361 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SMUG1Q53HV7 270 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ERMARDQ5T6L9 678 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BEND5Q7L4P6 421 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PRELID2Q8N945 189 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PARD6BQ9BYG5 372 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQH9 124 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 LILRB3O75022 631 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CD48P09326 243 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ATF6P18850 670 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DNAJB2P25686 324 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NME3Q13232 169 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TAZQ16635 292 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CYP1B1Q16678 543 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TPGS2Q68CL5 300 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SCD5Q86SK9 330 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 GPR65Q8IYL9 337 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CCDC185Q8N715 623 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD7Q92527 254 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ABHD8Q96I13 439 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PNKPQ96T60 521 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 COX16Q9P0S2 106 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FNIP2Q9P278 1114 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FZD10Q9ULW2 581 aa6.27□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RAD51CO43502 376 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 TJP3O95049 919 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 INMTO95050 263 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 SEC24AO95486 1093 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PGFP49763 221 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 NEK2P51955 445 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CDH6P55285 790 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 RAB33AQ14088 237 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DPYSL3Q14195 570 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 KRT81Q14533 505 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PDK2Q15119 407 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 CA9Q16790 459 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 ADAM32Q8TC27 787 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 VCX3BQ9H321 246 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
CCR6-201ENST00000341935 PIGVQ9NUD9 493 aa6.26□□□□□ -1.41
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