RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 I6L893 689 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTC1Q2NKJ3 1217 aa28.38■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC1BQ9P126 229 aa28.38■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GOT1P17174 413 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAZQ16635 292 aa28.37■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CSPG4P5Q96PW8 444 aa28.37■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF157Q96PX1 679 aa28.37■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACSL4O60488 711 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX10O75333 385 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TSC1Q92574 1164 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 AZIN2Q96A70 460 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CARD6Q9BX69 1037 aa28.36■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDH23Q9H251 3354 aa28.36■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTAGE15A4D2H0 777 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HCAR3P49019 387 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A13Q5J8X5 152 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3R6Q5UE93 754 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM72DQ6L9T8 149 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR153Q6NV75 609 aa28.35■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFX8Q6ZV50 586 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CFAP97Q9P2B7 532 aa28.35■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CST8O60676 142 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRIG2O94898 1065 aa28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL4RP24394 825 aa28.34■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RAP1GAP2Q684P5 730 aa28.34■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MTHFRP42898 656 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDH19Q8TAB3 1148 aa28.33■■■□□ 2.13
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZSWIM3Q96MP5 696 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 VANGL2Q9ULK5 521 aa28.33■■■□□ 2.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLKB1P03952 638 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TACR2P21452 398 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMPD1P23109 780 aa28.32■■■□□ 2.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL19A1Q14993 1142 aa28.32■■■□□ 2.12
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