RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 TCF4P15884 667 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HARS2P49590 506 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R40P59535 323 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ZXDAP98168 799 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM68Q6AZZ1 485 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HTR3DQ70Z44 454 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FAM131BQ86XD5 332 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CD101Q93033 1021 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 USP18Q9UMW8 372 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF510Q9Y2H8 683 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TNFRSF10AO00220 468 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FTCDO95954 541 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CCR1P32246 355 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NUGGCQ68CJ6 796 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PEX26Q7Z412 305 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ATP2A3Q93084 1043 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NTAN1Q96AB6 310 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 OTUB2Q96DC9 234 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PEBP4Q96S96 227 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 EBF3Q9H4W6 596 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 WDCPQ9H6R7 721 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 AMFRQ9UKV5 643 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PRPSAP2O60256 369 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NFATC1O95644 943 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SLC2A3P11169 496 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ARSAP15289 507 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 IL1R2P27930 398 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SSR1P43307 286 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TNK2Q07912 1038 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 EML3Q32P44 896 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 DENND1CQ8IV53 801 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CPA6Q8N4T0 437 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC185Q8N715 623 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 RNF34Q969K3 372 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ARNTLO00327 626 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 APOEP02649 317 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 AIF1P55008 147 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 RUNX3Q13761 415 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TUBB2AQ13885 445 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 MEI1Q5TIA1 1274 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 LRRC38Q5VT99 294 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZNB5 142 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 EDAQ92838 391 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TKTL2Q9H0I9 626 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HPS4Q9NQG7 708 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CA14Q9ULX7 337 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 COL4A2P08572 1712 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 I6L893 689 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PSTPIP1O43586 416 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 GREM1O60565 184 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 KLKB1P03952 638 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CTNNA2P26232 953 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ADRA1BP35368 520 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SCAPQ12770 1279 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 NR1H3Q13133 447 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ARL13BQ3SXY8 428 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 BOLA3Q53S33 107 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TTC8Q8TAM2 541 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 TEKT4Q8WW24 435 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HES6Q96HZ4 224 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ZWILCHQ9H900 591 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 FZD10Q9ULW2 581 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 LATS1O95835 1130 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 KRT7P08729 469 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 RARAP10276 462 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SLC11A2P49281 568 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-201ENST00000249504 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61 ms