RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233330.6

RTKN-201, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RTKN, Length 2,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-201ENST00000233330 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SMYD2Q9NRG4 433 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 HAUS2Q9NVX0 235 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SLC17A7Q9P2U7 560 aa20.33■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PTPRDP23468 1912 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM72CH0Y354 149 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 LPXNO60711 386 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SEMA3BQ13214 749 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 LPIN1Q14693 890 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 GALNTL6Q49A17 601 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM72AQ5TYM5 149 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM72BQ86X60 149 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 APOPT1Q96IL0 206 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SLC40A1Q9NP59 571 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa20.32■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 OPHN1O60890 802 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 B3GAT3O94766 335 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 AMHP03971 560 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 NEK3P51956 506 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CDK16Q00536 496 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ACBD6Q9BR61 282 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CYP11A1P05108 521 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ALADP13716 330 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 BRCC3P46736 316 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM171BQ6P995 826 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FITM2Q8N6M3 262 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FERMT1Q9BQL6 677 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 VPS11Q9H270 941 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 DDIT4Q9NX09 232 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 RRN3Q9NYV6 651 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.31■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 F5H423 210 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PYGBP11216 843 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 MLNP12872 115 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 WASHC5Q12768 1159 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CCNYQ8ND76 341 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ADAM2Q99965 735 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CEP41Q9BYV8 373 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PATJQ8NI35 1801 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 FAM159BA6NKW6 160 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 KRT37O76014 449 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ERCC2P18074 760 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ETV4P43268 484 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 GRIK3Q13003 919 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 METTL23Q86XA0 190 aa20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 M0QZQ0 153 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CSH1P0DML2 217 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CSH2P0DML3 217 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TPI1P60174 286 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 BNIP1Q12981 228 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 TUSC3Q13454 348 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 ZNF567Q8N184 647 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 HASPINQ8TF76 798 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 EDEM1Q92611 657 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PGBD4Q96DM1 585 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PKMYT1Q99640 499 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 WDR91A4D1P6 747 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 UGT1A9O60656 530 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 BDNFP23560 247 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PSMB4P28070 264 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 HCAR3P49019 387 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 CAP1Q01518 475 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PARP6Q2NL67 630 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.29■□□□□ 0.84
RTKN-201ENST00000233330 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms