RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r54K7N649 806 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GpiP06745 558 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atxn1lP0C7T6 687 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd247P24161 164 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adh5P28474 374 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptger1P35375 405 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wee1P47810 646 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mc4rP56450 332 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1fP70248 1099 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rad54lP70270 747 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cep76Q0VEJ0 659 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem255bQ5FW56 369 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gcnt3Q5JCT0 437 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dhrs13Q5SS80 376 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HarsQ61035 509 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9a4Q8BUE1 797 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam221aQ8C790 301 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Parp9Q8CAS9 866 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mtrf1Q8K126 446 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cox18Q8VC74 331 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med25Q8VCB2 745 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdxdc1Q99K01 787 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab11fip1Q9D620 645 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndst4Q9EQW8 872 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnase2bQ9QY48 354 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem196V9GX04 182 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PikfyveQ9Z1T6 2097 aa11.62□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Etnk2A7MCT6 385 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm28042B7ZCM9 1014 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rfx8D3YU81 596 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8113E0CXS8 587 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700011I03RikE9PYL8 271 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm7714E9Q079 131 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Enthd1E9Q1Z2 618 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrna9G3X8Z7 479 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmco2P0C1V4 183 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a2P18581 657 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighmbp2P40694 993 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SftpdP50404 374 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtswP56203 371 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MplQ08351 625 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nell1Q2VWQ2 810 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tcerg1lQ3B807 590 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Msi1Q61474 362 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ovgp1Q62010 721 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pon2Q62086 354 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sorbs1Q62417 1290 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NovQ64299 354 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lemd2Q6DVA0 511 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DrgxQ8BYH0 263 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MtrrQ8C1A3 696 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp15Q8R4V2 235 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr805Q8VFI4 319 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr342Q8VGK7 312 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl13Q91YR5 698 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfap3Q922T2 349 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Filip1Q9CS72 1211 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AticQ9CWJ9 592 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med7Q9CZB6 233 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alg14Q9D081 217 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd7Q9D504 279 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cbx6Q9DBY5 414 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlr9Q9EQU3 1032 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sphk2Q9JIA7 617 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtsrQ9JIA9 334 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 St6galnac4Q9R2B6 360 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ror1Q9Z139 937 aa11.61□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dthd1E9PZX1 795 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sp1O89090 784 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajb5O89114 348 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AfpP02772 605 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlauP06869 433 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtmaP26350 111 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FynP39688 537 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GlaP51569 419 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga11P61622 1188 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Smpdl3aP70158 445 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tie1Q06806 1134 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agxt2Q3UEG6 513 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Garem1Q3UFT3 876 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp36l3Q5ISE2 725 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec2eQ80XD9 204 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q80ZQ3 298 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Heatr3Q8BQM4 679 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankk1Q8BZ25 745 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf668Q8K2R5 619 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sertad3Q9ERC3 197 aa11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csnk1eQ9JMK2 416 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 41 ms