RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602164.5

USF2-215, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, human

TSL 3

Gene USF2, Length 582 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USF2-215	ENST00000602164	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RNF43	Q68DV7	783 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TRNP1	Q6NT89	227 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RNF214	Q8ND24	703 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NT5C3B	Q969T7	300 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NPY6R	Q99463	290 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		27.88	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164		A0A1W2PQJ5	194 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PLA2G5	P39877	138 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PRKCI	P41743	596 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SLC11A2	P49281	568 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SGSH	P51688	502 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ASIC2	Q16515	512 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PHOX2B	Q99453	314 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NUP58	Q9BVL2	599 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	DDIT4	Q9NX09	232 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	HCN2	Q9UL51	889 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		27.87	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TSPAN3	O60637	253 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	HOXC13	P31276	330 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	FLT3	P36888	993 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NBL1	P41271	181 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TNFRSF4	P43489	277 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SEC13	P55735	322 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	MPPE1	Q53F39	396 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	MON1B	Q7L1V2	547 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ARC	Q7LC44	396 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		27.86	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ATG13	O75143	517 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	CYBB	P04839	570 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	DGKG	P49619	791 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	EMC10	Q5UCC4	262 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	RRN3	Q9NYV6	651 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		27.85	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PRRT4	C9JH25	899 aa		27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	APOE	P02649	317 aa		27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	BNIPL	Q7Z465	357 aa		27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	DDI1	Q8WTU0	396 aa		27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	METTL5	Q9NRN9	209 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164		M0QYT0	321 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GYPC	P04921	128 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	GBP1	P32455	592 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PPP2R5D	Q14738	602 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	C2orf27A	Q580R0	203 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SYT13	Q7L8C5	426 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ACD	Q96AP0	544 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	IQCD	Q96DY2	449 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	TBCB	Q99426	244 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	PIGV	Q9NUD9	493 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		27.83	■■■□□ 2.05
USF2-215	ENST00000602164	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		27.82	■■■□□ 2.04
USF2-215	ENST00000602164	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		27.82	■■■□□ 2.04
USF2-215	ENST00000602164	HOXA6	P31267	233 aa		27.82	■■■□□ 2.04
USF2-215	ENST00000602164	CCR1	P32246	355 aa		27.82	■■■□□ 2.04

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