RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594640.1

PTOV1-204, Transcript of prostate tumor overexpressed 1, human

TSL 3

Gene PTOV1, Length 490 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTOV1-204	ENST00000594640	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TULP3	O75386	442 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	EGF	P01133	1207 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	APOD	P05090	189 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	KRT3	P12035	628 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	SKIL	P12757	684 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CASP14	P31944	242 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CXCR3	P49682	368 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TRIM5	Q9C035	493 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	WDCP	Q9H6R7	721 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DDIT4	Q9NX09	232 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.23	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TIMM44	O43615	452 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RTN2	O75298	545 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	KAT7	O95251	611 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	APOE	P02649	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TPM1	P09493	284 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ABCB4	P21439	1286 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CXCL12	P48061	93 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	MTAP	Q13126	283 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	VPS36	Q86VN1	386 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C12orf40	Q86WS4	652 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C3orf20	Q8ND61	904 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RNF34	Q969K3	372 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C1orf74	Q96LT6	269 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DNAJC7	Q99615	494 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ISCU	Q9H1K1	167 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.22	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	AP5Z1	O43299	807 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	LAMTOR5	O43504	91 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	HOXA6	P31267	233 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	FLT3	P36888	993 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PTPN9	P43378	593 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DGKG	P49619	791 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CCR3	P51677	355 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PTPN5	P54829	565 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DEUP1	Q05D60	604 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TCF15	Q12870	199 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	NME3	Q13232	169 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	GAS6	Q14393	721 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	E2F5	Q15329	346 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CCDC14	Q49A88	953 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
PTOV1-204	ENST00000594640	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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