RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM131B	Q86XD5	332 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RFX6	Q8HWS3	928 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PQLC3	Q8N755	202 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PIGV	Q9NUD9	493 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		15.96	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF487	B1APH4	448 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318		M0QYT0	321 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GAS8	O95995	478 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TIMP1	P01033	207 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC5A3	P53794	718 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PLTP	P55058	493 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	KRT81	Q14533	505 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF280D	Q6N043	979 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	HOOK3	Q86VS8	718 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ALLC	Q8N6M5	410 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TTC13	Q8NBP0	860 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ART4	Q93070	314 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TOP1MT	Q969P6	601 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF670	Q9BS34	389 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	FZD10	Q9ULW2	581 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		15.95	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	OR6C75	A6NL08	312 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	KIAA0355	O15063	1070 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	WFS1	O76024	890 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ITGAV	P06756	1048 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	CSF2RA	P15509	400 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GRIK1	P39086	918 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PLD5	Q8N7P1	536 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	FMO2	Q99518	471 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	WHRN	Q9P202	907 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318		I6L893	689 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	VNN2	O95498	520 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NCAM1	P13591	858 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GBP1	P32455	592 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	DEFB103A	P81534	67 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NPNT	Q6UXI9	565 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ADAM32	Q8TC27	787 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	EDEM1	Q92611	657 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TLCD1	Q96CP7	247 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		15.94	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPN9	O14815	690 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	AMH	P03971	560 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR15	P49685	360 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PGF	P49763	221 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	DEUP1	Q05D60	604 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	TFDP2	Q14188	446 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	NOMO1	Q15155	1222 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	VSTM1	Q6UX27	236 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	ZFAT	Q9P243	1243 aa		15.93	■□□□□ 0.14
DDX39A-209	ENST00000589318	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		15.93	■□□□□ 0.14

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