RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	NAA35	Q5VZE5	725 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM215	Q68D42	235 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRNP1	Q6NT89	227 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ERICH1	Q86X53	443 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF677	Q86XU0	584 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	AZIN2	Q96A70	460 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	C18orf8	Q96DM3	657 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	NOX5	Q96PH1	765 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	HHIP	Q96QV1	700 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPAG5	Q96R06	1193 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ACOX2	Q99424	681 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RASGRF1-208	ENST00000561112	CFAP54	Q96N23	3096 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	GFRA3	O60609	400 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	HSF2BP	O75031	334 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PBX1	P40424	430 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	DGKG	P49619	791 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NRL	P54845	237 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	FANCC	Q00597	558 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTP4A2	Q12974	167 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NNT	Q13423	1086 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NFKBIB	Q15653	356 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	CRY1	Q16526	586 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	MPPE1	Q53F39	396 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNF43	Q68DV7	783 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NT5C3B	Q969T7	300 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SERPINB11	Q96P15	392 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SYT11	Q9BT88	431 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	EML5	Q05BV3	1969 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PQC6	194 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	DAB1	O75553	588 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	MMP8	P22894	467 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	HLA-F	P30511	346 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NOS2	P35228	1153 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	FLT3	P36888	993 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	WAS	P42768	502 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	LMLN	Q96KR4	655 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	NPY6R	Q99463	290 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	EPC1	Q9H2F5	836 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SYNC	Q9H7C4	482 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112		A0A1W2PQF6	199 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	LRRC53	A6NM62	1247 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112		M0QYT0	321 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	GJB6	O95452	261 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RASGRF1-208	ENST00000561112	SERPINC1	P01008	464 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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