RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP250Q9BV73 2442 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR23AA6NEV1 266 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 B5MCH6 92 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRNA1P02708 482 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITGB1P05556 798 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGFB3P10600 412 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ICAM3P32942 547 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDUFV1P49821 464 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NT5C2P49902 561 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 HAND2P61296 217 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 LPIN1Q14693 890 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1QL3Q5VWW1 255 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR3DQ70Z44 454 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 HDAC10Q969S8 669 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CACNA1BQ00975 2339 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABLIM3O94929 683 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 GHRP10912 638 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACRV1P26436 265 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBL1P41271 181 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 EPHB1P54762 984 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP10-2P60368 255 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SP140Q13342 867 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNC3Q14003 757 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35G1Q2M3R5 365 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 LCE1DQ5T752 114 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL7BQ6UX53 244 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6ZRM9 215 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPPL3Q8TCT6 385 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR20Q99678 358 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 LDAHQ9H6V9 325 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SETD4Q9NVD3 440 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC154A6NI56 674 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSPG5O95196 566 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 AVPR2P30518 371 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCNN1GP51170 649 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO47Q5MNV8 452 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ODR4Q5SWX8 454 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKS6Q68DC2 871 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAF2Q6P1X5 1199 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 TICAM2Q86XR7 235 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 XYLT1Q86Y38 959 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIER2Q8N344 545 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 ESR2Q92731 530 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSRNP2Q9H175 543 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-AS1-204ENST00000559861 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRCAMQ92823 1304 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 E2F8A0AVK6 867 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 AKAP10O43572 662 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCND2P30279 289 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRIP1P48552 1158 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAN2A2P49641 1150 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFSD6Q6ZSS7 791 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHOT1Q8IXI2 618 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 POF1BQ8WVV4 589 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP2R3CQ969Q6 453 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 EVI5LQ96CN4 794 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR87Q9BY21 358 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM140Q9NV12 185 aa9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
USP3-AS1-204ENST00000559861 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms