RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558593.1

GABPB1-AS1-203, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GABPB1-AS1, Length 507 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SHDQ96IW2 340 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC138Q96M89 665 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IL25Q9H293 177 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KCTD10Q9H3F6 313 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CLSTN2Q9H4D0 955 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 BRD9Q9H8M2 597 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LTB4R2Q9NPC1 389 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SEMA4GQ9NTN9 838 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 UBP1Q9NZI7 540 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.14□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ACACBO00763 2458 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZMYM6O95789 1325 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 B4E171 279 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GABRDO14764 452 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC30A4O14863 429 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PLATP00750 562 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 F13BP05160 661 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IMPDH2P12268 514 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LAMP2P13473 410 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SDHBP21912 280 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MCM4P33991 863 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM189BP81408 668 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC7A5Q01650 507 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CDC16Q13042 620 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TRAF1Q13077 416 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MTAPQ13126 283 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SEZ6Q53EL9 994 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC45A4Q5BKX6 768 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CCDC186Q7Z3E2 898 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LURAP1LQ8IV03 231 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KSR1Q8IVT5 923 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DEPTORQ8TB45 409 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ITFG1Q8TB96 612 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NETO1Q8TDF5 533 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 DENND1AQ8TEH3 1009 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 STAMQ92783 540 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LRRC45Q96CN5 670 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 C1orf74Q96LT6 269 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NLRP4Q96MN2 994 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 MXRA8Q9BRK3 442 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CRB3Q9BUF7 120 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LRRC3Q9BY71 257 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GPR34Q9UPC5 381 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 WDR81Q562E7 1941 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 A0A087WZ62 844 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 NRP1O14786 923 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 SPTLC2O15270 562 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 P4HA2O15460 535 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 LRIG2O94898 1065 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 TGDSO95455 350 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 FAM87AP0C7U9 286 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CALM1P0DP23 149 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CALM2P0DP24 149 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 CALM3P0DP25 149 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PF4V1P10720 104 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PCP11498 1178 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GRIK1P39086 918 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 HNF4AP41235 474 aa7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
GABPB1-AS1-203ENST00000558593 GPC3P51654 580 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms