RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557397.5

TIMM9-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 4

Gene TIMM9, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-210	ENST00000557397	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NDUFS1	P28331	727 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ATIC	P31939	592 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZBED1	O96006	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	DRD1	P21728	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MATN1	P21941	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MMP8	P22894	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MT3	P25713	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MLH1	P40692	756 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	BFSP2	Q13515	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397		F8W8V4	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	KRT86	O43790	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	COQ9	O75208	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	AKR1A1	P14550	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PEX2	P28328	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	KCNJ4	P48050	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	AGTR2	P50052	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	FAM193A	P78312	1265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	KRT81	Q14533	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ELF2	Q15723	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NXN	Q6DKJ4	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	MIB2	Q96AX9	1013 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	WDR24	Q96S15	920 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	EMSY	Q7Z589	1322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397		H0YGN5	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ACOT8	O14734	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TPP1	O14773	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	THAP12	O43422	761 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	IL18RAP	O95256	599 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	SGPL1	O95470	568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	AR	P10275	920 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CHRNB1	P11230	501 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	STAT6	P42226	847 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	LTB	Q06643	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	GPS1	Q13098	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NFATC4	Q14934	902 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PGM5	Q15124	567 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	LPAR1	Q92633	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	EME1	Q96AY2	570 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TIMM9-210	ENST00000557397	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms