RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534617.5

BRMS1-209, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 905 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-209ENST00000534617 TMEM110Q86TL2 294 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 OLIG1Q8TAK6 271 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 RLN3Q8WXF3 142 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 NOX5Q96PH1 765 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CPXM1Q96SM3 734 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 GABRG3Q99928 467 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 SLC2A11Q9BYW1 496 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CIPCQ9C0C6 399 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 VPS16Q9H269 839 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 ANO10Q9NW15 660 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.6□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CEP250Q9BV73 2442 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 A0A1W2PQF6 199 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 ACSL4O60488 711 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 TPM2P07951 284 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 GABRG2P18507 467 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CLCN1P35523 988 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 ARHGAP8P85298 464 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CREB5Q02930 508 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 KRT31Q15323 416 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CCDC183Q5T5S1 534 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CDKAL1Q5VV42 579 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 UCMAQ8WVF2 138 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 SYNCQ9H7C4 482 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 CEP83Q9Y592 693 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.59□□□□□ -0.07
BRMS1-209ENST00000534617 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 WASH3PC4AMC7 463 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GFRA2O00451 464 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 IRAK2O43187 625 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MAP3K13O43283 966 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TBL1XO60907 577 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 APOEP02649 317 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 UCHL3P15374 230 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NDUFV2P19404 249 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SLC6A4P31645 630 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 P2RY2P41231 377 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 BPIFB4P59827 614 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 MYL5Q02045 173 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ARID5AQ03989 594 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NNTQ13423 1086 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 STARD3Q14849 445 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TAF5Q15542 800 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 BEND5Q7L4P6 421 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 FRMD1Q8N878 549 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 LHX5Q9H2C1 402 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 STIM2Q9P246 746 aa14.58□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 THADAQ6YHU6 1953 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 FAM170AA1A519 330 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 GRAP2O75791 330 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 ERBB2P04626 1255 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 SDHBP21912 280 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 HLA-FP30511 346 aa14.57□□□□□ -0.08
BRMS1-209ENST00000534617 IL12RB1P42701 662 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms