RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533012.1

TRAPPC4-211, Transcript of trafficking protein particle complex 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC4, Length 817 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4-211ENST00000533012 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADGRF1Q5T601 910 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 TMEM25Q86YD3 366 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 DDI1Q8WTU0 396 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 RFFLQ8WZ73 363 aa11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 MSANTD3Q96H12 275 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 SHDQ96IW2 340 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 C1orf74Q96LT6 269 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 HAPLN3Q96S86 360 aa11.65□□□□□ -0.54
TRAPPC4-211ENST00000533012 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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TRAPPC4-211ENST00000533012 A0A0C4DFX4 3053 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PI4K2BG5E9Z4 385 aa11.64□□□□□ -0.55
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TRAPPC4-211ENST00000533012 PRPSAP2O60256 369 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 TSPAN3O60637 253 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MTA2O94776 668 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CYP17A1P05093 508 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ADH5P11766 374 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 GJA4P35212 333 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ARHGAP25P42331 645 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 AIF1P55008 147 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCZ1BP86790 482 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 PRKCQQ04759 706 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 KIF5AQ12840 1032 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 RAB6CQ53S08 254 aa11.64□□□□□ -0.55
TRAPPC4-211ENST00000533012 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.64□□□□□ -0.55
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