RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NNT	Q13423	1086 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GEN1	Q17RS7	908 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SHC3	Q92529	594 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF292	O60281	2723 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DMD	P11532	3685 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	BECN2	A8MW95	431 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393		E5RJQ4	531 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GDF9	O60383	454 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ACSL4	O60488	711 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	IGLV3-27	P01718	113 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	APOE	P02649	317 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KRT9	P35527	623 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	LIMK1	P53667	647 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	BPIFB4	P59827	614 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PDCL	Q13371	301 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MPP7	Q5T2T1	576 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFV2	P19404	249 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	APBA1	Q02410	837 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	AHI1	Q8N157	1196 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PIGK	Q92643	395 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	ACP6	Q9NPH0	428 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GGA2	Q9UJY4	613 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RBBP4-215	ENST00000524393	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	WASH3P	C4AMC7	463 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	TBL1X	O60907	577 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFS2	O75306	463 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	FYN	P06241	537 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHX1	P07099	455 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	GLI1	P08151	1106 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	IL12RB1	P42701	662 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF234	Q14588	700 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	MIIP	Q5JXC2	388 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	STPG1	Q5TH74	334 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	CHST9	Q7L1S5	443 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RBBP4-215	ENST00000524393	TAC4	Q86UU9	113 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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