RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 HACD1B0YJ81 288 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 AVILO75366 819 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 AMHP03971 560 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CCT5P48643 541 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC5A3P53794 718 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 AP1B1Q10567 949 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SCAPQ12770 1279 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TMED2Q15363 201 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 NLRP14Q86W24 1093 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 VPS52Q8N1B4 723 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CCNYQ8ND76 341 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CENPTQ96BT3 561 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TSC2P49815 1807 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 METTL18O95568 372 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 GCAP28676 217 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TPI1P60174 286 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 DPYSQ14117 519 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 MTFR1Q15390 333 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TAC4Q86UU9 113 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SEPT8Q92599 483 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CCT8L2Q96SF2 557 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM107BQ9H098 131 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 KCNK9Q9NPC2 374 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.1■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FRMPD3Q5JV73 1810 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ALDH2P05091 517 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 VAV1P15498 845 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ERCC2P18074 760 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ELK3P41970 407 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CXCR3P49682 368 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 GATMP50440 423 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 PDK1Q15118 436 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ABCC13Q9NSE7 274 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 EURLQ9NYK6 297 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 RABGEF1Q9UJ41 708 aa18.09■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 RASA4BC9J798 803 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 PITPNM1O00562 1244 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TNFRSF10BO14763 440 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 DCLK1O15075 740 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 RASA4O43374 803 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 BRAFP15056 766 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TDRPQ86YL5 185 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 IGDCC3Q8IVU1 814 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FBF1Q8TES7 1133 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 CASD1Q96PB1 797 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.08■□□□□ 0.49
TSNARE1-204ENST00000519651 TMEM120BA0PK00 339 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SYN3O14994 580 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SEMA3BQ13214 749 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 MAML1Q92585 1016 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 P2RY11Q96G91 374 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.08■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM107AO95990 144 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 HCAR3P49019 387 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SCLYQ96I15 445 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PGLYRP2Q96PD5 576 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 RNF208Q9H0X6 261 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 PPCSQ9HAB8 311 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SEPT10Q9P0V9 454 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC24A2Q9UI40 661 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SNX10Q9Y5X0 201 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 249.9
TSNARE1-204ENST00000519651 PIAS1O75925 651 aa18.07■□□□□ 0.48
TSNARE1-204ENST00000519651 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms