RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q8N7P7 452 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CNBD1Q8NA66 436 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LMBR1Q8WVP7 490 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DEPDC7Q96QD5 511 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM51Q9BSJ1 452 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDK19Q9BWU1 502 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MLXIPLQ9NP71 852 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM160Q9NX00 188 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBC1D14Q9P2M4 693 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CPNE7Q9UBL6 633 aa0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRSS29PA6NIE9 313 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MS4A18H0YCH9 400 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFNL4K9M1U5 179 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST6GAL1P15907 406 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MALP21145 153 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADORA2AP29274 412 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRKAR1BP31321 381 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCR10P46092 362 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 AMTP48728 403 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DGKEP52429 567 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 WNT3P56703 355 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LY6KQ17RY6 165 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MGAT5BQ3V5L5 792 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TOR2AQ5JU69 321 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCAF12L2Q5VW00 463 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF774Q6NX45 483 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF343Q6P1L6 599 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TUBA1AQ71U36 451 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC26A9Q7LBE3 791 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTC7BQ86TV6 843 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CAMK1DQ8IU85 385 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CPA6Q8N4T0 437 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00612Q8N6U2 182 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM71DQ8N9W8 422 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPATA20Q8TB22 786 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SECTM1Q8WVN6 248 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DPF2Q92785 391 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 EME1Q96AY2 570 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLPTM1LQ96KA5 538 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00479Q96M42 142 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 C17orf77Q96MU5 243 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SENP7Q9BQF6 1050 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 C17orf80Q9BSJ5 609 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTLL2Q9BWV7 592 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 WDCPQ9H6R7 721 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXorf36Q9H7Y0 433 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP6D1Q9H9H5 199 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 COL20A1Q9P218 1284 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNX14Q9Y5W7 946 aa0.64□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 A8MVJ9 347 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCDH17O14917 1159 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARHGEF9O43307 516 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 FGF5P12034 268 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTGER3P43115 390 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTNR1BP49286 362 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC16A1P53985 500 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCAT1P54687 386 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPC5P78333 572 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST3GAL2Q16842 350 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ASPHD1Q5U4P2 390 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SWSAP1Q6NVH7 229 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRIG3Q6UXM1 1119 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LRRTM1Q86UE6 522 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 C11orf53Q8IXP5 236 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM47BQ8NA70 645 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 NRG4Q8WWG1 115 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 SORCS1Q8WY21 1168 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 VPS50Q96JG6 964 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00167Q96N53 147 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC7Q99615 494 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 VN1R3Q9BXE9 311 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDZD7Q9H5P4 517 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 GAREM1Q9H706 876 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 DNAJC28Q9NX36 388 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 LPAR3Q9UBY5 353 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa0.63□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A1W2PS18 150 aa0.62□□□□□ -2.31
RNU6-162P-201ENST00000516228 HMX3A6NHT5 357 aa0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms