RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC157Q569K6 752 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAJC24Q6P3W2 148 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM124AQ86V42 546 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM131BQ86XD5 332 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DEFB106AQ8N104 65 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FBXL6Q8N531 539 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 EXOC4Q96A65 974 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CHFRQ96EP1 664 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 C8orf48Q96LL4 319 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 F11P03951 625 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PDGFRAP16234 1089 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 MAGEA11P43364 429 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G4AP47712 749 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PGFP49763 221 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 STILQ15468 1287 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC01559Q495D7 138 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 EMC10Q5UCC4 262 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PAQR9Q6ZVX9 377 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 WHAMMQ8TF30 809 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 HMGB4Q8WW32 186 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SNX19Q92543 992 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM81BQ96LP2 452 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 FRMD6Q96NE9 622 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 STK33Q9BYT3 514 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 R4GN57 208 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ADH1CP00326 375 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CASP14P31944 242 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SOX5P35711 763 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DEUP1Q05D60 604 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM25Q86YD3 366 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC42Q96M95 316 aa6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 REV3LO60673 3130 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PAEPP09466 180 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SDC4P31431 198 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNMA1Q12791 1236 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 NFIL3Q16649 462 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 LGI2Q8N0V4 545 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CXorf38Q8TB03 319 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP2A3Q93084 1043 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF653Q96CK0 615 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CPXM1Q96SM3 734 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 VANGL2Q9ULK5 521 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ACADSBP45954 432 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ST8SIA6P61647 398 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 PDCLQ13371 301 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 MIIPQ5JXC2 388 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 LEKR1Q6ZMV7 388 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZS52 159 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 GPR65Q8IYL9 337 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 SPATA18Q8TC71 538 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 MUC3BQ9H195 1237 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 WDCPQ9H6R7 721 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ECT2Q9H8V3 914 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 IL21Q9HBE4 155 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.8□□□□□ -1.32
RRN3P1-201ENST00000514813 NRDCO43847 1150 aa6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms