RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCAM1	P13591	858 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXB2	P14652	356 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	HLA-F	P30511	346 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RY2	P41231	377 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLK7	P49862	253 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBX4	P57082	545 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NNT	Q13423	1086 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT31	Q15323	416 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC6	Q16204	474 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PMS2CL	Q68D20	193 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM32	Q8TC27	787 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RLN3	Q8WXF3	142 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAN	Q9H2C0	597 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LHX5	Q9H2C1	402 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	GDF9	O60383	454 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACSL4	O60488	711 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERBB2	P04626	1255 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	UCHL3	P15374	230 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL12RB1	P42701	662 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NCAPH	Q15003	741 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD93	Q9NPY3	652 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	FANCL	Q9NW38	375 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	EPHB6	O15197	1021 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	IRAK2	O43187	625 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ALDH1A2	O94788	518 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CYBB	P04839	570 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF806	P0C7X5	589 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF18	P17022	549 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFV2	P19404	249 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LMNB2	Q03252	620 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PTK2	Q05397	1052 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS16	Q9H269	839 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8VZ95	297 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOBTB1	O94844	696 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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