RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 BTF3P20290 206 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ACVR2AP27037 513 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PPM1AP35813 382 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 GPC5P78333 572 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 CFHR3Q02985 330 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 STK3Q13188 491 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MPEG1Q2M385 716 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ARL13BQ3SXY8 428 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 NUGGCQ68CJ6 796 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 RNF44Q7L0R7 432 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 YAF2Q8IY57 180 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 POF1BQ8WVV4 589 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PPP1R9BQ96SB3 815 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 CRB3Q9BUF7 120 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 COLEC11Q9BWP8 271 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PTPRHQ9HD43 1115 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 RIMKLBQ9ULI2 386 aa2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 A0A087WZ62 844 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 SLC22A23A1A5C7 686 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 F5H423 210 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 RGS10O43665 173 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 RRP9O43818 475 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 NDUFB8O95169 186 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 GAS8-AS1O95177 125 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 NDST3O95803 873 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MYL4P12829 197 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 EPHA3P29320 983 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PRKAR1BP31321 381 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 TRAPPC10P48553 1259 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 HSPA7P48741 367 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ZXDBP98169 803 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 BTKQ06187 659 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ARHGEF7Q14155 803 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 SLC29A2Q14542 456 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 KCNAB1Q14722 419 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ASIC2Q16515 512 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 C9orf50Q5SZB4 431 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PLAG1Q6DJT9 500 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 USP49Q70CQ1 688 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 RFX6Q8HWS3 928 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 BRI3BPQ8WY22 251 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ZNF566Q969W8 418 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 C18orf8Q96DM3 657 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 LMLNQ96KR4 655 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 PSMD1Q99460 953 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 USP29Q9HBJ7 922 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ARFGAP3Q9NP61 516 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 SNX15Q9NRS6 342 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 TMEM45AQ9NWC5 275 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 ZSCAN32Q9NX65 697 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 SELENONQ9NZV5 590 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 CEP83Q9Y592 693 aa2.84□□□□□ -1.95
RBM39-242ENST00000498280 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.84□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 A0A087WV62 115 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 FAM234BA2RU67 622 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 CLCA1A8K7I4 914 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 AREL1O15033 823 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 TMPRSS11DO60235 418 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 PIAS2O75928 621 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 EPN2O95208 641 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 PLAUP00749 431 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 NGFRP08138 427 aa2.83□□□□□ -1.96
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RBM39-242ENST00000498280 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
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RBM39-242ENST00000498280 TECP42680 631 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 CPT1AP50416 773 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 GATMP50440 423 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 B4GALNT1Q00973 533 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 TRIM14Q14142 442 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 INSCQ1MX18 579 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 TUBB8Q3ZCM7 444 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 C4orf46Q504U0 113 aa2.83□□□□□ -1.96
RBM39-242ENST00000498280 FAM83BQ5T0W9 1011 aa2.83□□□□□ -1.96
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