RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CYTH2Q99418 400 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PKMYT1Q99640 499 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 GGA2Q9UJY4 613 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 FBXW11Q9UKB1 542 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PPM1 405 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 TCP11X1B4DZS4 312 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 B4GALT3O60512 393 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DPYSQ14117 519 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SLC24A5Q71RS6 500 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CCNYQ8ND76 341 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 NTAN1Q96AB6 310 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SENP1Q9P0U3 644 aa17.29■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 A0A1W2PQY0 241 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 F5H423 210 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 I6L893 689 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 AMHP03971 560 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PAX3P23760 479 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 AIF1P55008 147 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 BSPRYQ5W0U4 402 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ADGRD1Q6QNK2 874 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CKAP2Q8WWK9 683 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 STARD7Q9NQZ5 370 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CREBZFQ9NS37 354 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 RRN3Q9NYV6 651 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 A0A0A0MRY4 1105 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 INHAP05111 366 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SCAPQ12770 1279 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CLLU1OSQ5K130 101 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 MCUQ8NE86 351 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 IRGQQ8WZA9 623 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SPATA13Q96N96 652 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DHRS4Q9BTZ2 278 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SEPT10Q9P0V9 454 aa17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 INPPL1O15357 1258 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SPAG6O75602 509 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DDHD2O94830 711 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 EOMESO95936 686 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 F9P00740 461 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 TPI1P60174 286 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PDK1Q15118 436 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 LHX8Q68G74 356 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PM20D1Q6GTS8 502 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 C6orf89Q6UWU4 347 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 OTUD6BQ8N6M0 293 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SCAMP5Q8TAC9 235 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 DCAKDQ8WVC6 231 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 LINC01599Q8WXQ3 324 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 P2RY11Q96G91 374 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SGSM3Q96HU1 749 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 CEP41Q9BYV8 373 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.27■□□□□ 0.36
TOM1-216ENST00000492723 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 RNF103O00237 685 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 TRIM66O15016 1216 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 DCLK1O15075 740 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 STK10O94804 968 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 TPSB2P20231 275 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 TPSAB1Q15661 275 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 FERMT1Q9BQL6 677 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 PRDM12Q9H4Q4 367 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 WDCPQ9H6R7 721 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 IKBKGQ9Y6K9 419 aa17.27■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 ERCC2P18074 760 aa17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 KRT4P19013 534 aa17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 TYMPP19971 482 aa17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 WDR4P57081 412 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TOM1-216ENST00000492723 SEMA5AQ13591 1074 aa17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms