RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.05■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.05■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.05■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.05■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NRP1O14786 923 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TYROBPO43914 113 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPHB2P29323 1055 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MXRA7P84157 204 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAAP100Q0VG06 881 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR1H3Q13133 447 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTK7Q13308 1070 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF43Q68DV7 783 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SENP8Q96LD8 212 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT82Q9NSB4 513 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL5CA6NH57 179 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AHCYL1O43865 530 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LPXNO60711 386 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APRTP07741 180 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC10A3P09131 477 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH3A1P30838 453 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLE2P56282 527 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IRX4P78413 519 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRADDP78560 199 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BMPR2Q13873 1038 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.04■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFAP69A5D8W1 941 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ9O75208 318 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INHBAP08476 426 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4Q2P0C623 313 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFHC2Q5JST6 749 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERAC1Q96JX3 654 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGMNQ99538 433 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFATQ9P243 1243 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOD1Q9Y239 953 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 M0QZ92 97 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP17L7P0C7H9 530 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBP50607 506 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DSTYKQ6XUX3 929 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCGF5Q86SE9 256 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTC13Q8NBP0 860 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF157Q96PX1 679 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRPM7Q96QT4 1865 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PADI3Q9ULW8 664 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.03■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 B3GAT3O94766 335 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOC2P02655 101 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP2F1P24903 491 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SULT1E1P49888 294 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBTB16Q05516 673 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM110Q86TL2 294 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD52Q8NB46 1076 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MECRQ9BV79 373 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A9O60656 530 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BGNP21810 368 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SDHAF4Q5VUM1 108 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FYB2Q5VWT5 728 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LONP2Q86WA8 852 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LRRC52Q8N7C0 313 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACSS3Q9H6R3 686 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A7Q9HAW7 530 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A10Q9HAW8 530 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT1A8Q9HAW9 530 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXLNGQ9NUQ3 528 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.02■□□□□ 0.16
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms