RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487876.1

RPSA-208, Transcript of ribosomal protein SA, human

TSL 4

Gene RPSA, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPSA-208	ENST00000487876	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NUP205	Q92621	2012 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CAPN9	O14815	690 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	GRAP2	O75791	330 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CYP11B1	P15538	503 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC6A4	P31645	630 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	KRT9	P35527	623 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SYCP1	Q15431	976 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	EOGT	Q5NDL2	527 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	RASSF3	Q86WH2	238 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	LGALS16	A8MUM7	142 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	ACSL4	O60488	711 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	GFPT2	O94808	682 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	LATS1	O95835	1130 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CYBB	P04839	570 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TPM2	P07951	284 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	JAM2	P57087	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TMEM215	Q68D42	235 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CHPF	Q8IZ52	775 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	HMGB4	Q8WW32	186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876		A0A1W2PQF6	199 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	WASH3P	C4AMC7	463 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	IRAK2	O43187	625 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	IGLV3-25	P01717	112 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	MME	P08473	750 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	HOXB2	P14652	356 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	BCKDHB	P21953	392 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TGM1	P22735	817 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	HLA-F	P30511	346 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NTSR1	P30989	418 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SLC11A2	P49281	568 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	BPIFB4	P59827	614 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	RING1	Q06587	406 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NNT	Q13423	1086 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	C2CD6	Q53TS8	623 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	BEND5	Q7L4P6	421 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	FRMD1	Q8N878	549 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	GABRG3	Q99928	467 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPSA-208	ENST00000487876	COX16	Q9P0S2	106 aa		13.41	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms