RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FLCN	Q8NFG4	579 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BHMT	Q93088	406 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NT5C3B	Q969T7	300 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BBS2	Q9BXC9	721 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PIGV	Q9NUD9	493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM51	Q9NW97	253 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CCP110	O43303	1012 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PSMA2	P25787	234 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CXCR3	P49682	368 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GSDMD	P57764	484 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	STARD6	P59095	220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PON2	Q15165	354 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SPA17	Q15506	151 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ADGRF1	Q5T601	910 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	STRADA	Q7RTN6	431 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CPXM2	Q8N436	756 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NAT16	Q8N8M0	369 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	AZIN2	Q96A70	460 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PLK2	Q9NYY3	685 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NENF	Q9UMX5	172 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	KANSL1L	A0AUZ9	987 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CYP1A2	P05177	515 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TYR	P14679	529 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEA1	P43355	309 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	MTA1	Q13330	715 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM131B	Q86XD5	332 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CD101	Q93033	1021 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NELL2	Q99435	816 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NUP85	Q9BW27	656 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019		F5H5T6	163 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RNF8	O76064	485 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	ENDOD1	O94919	500 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TACR2	P21452	398 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC6A4	P31645	630 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	SLC6A11	P48066	632 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GALK1	P51570	392 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	OGDH	Q02218	1023 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	GSE1	Q14687	1217 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	BNIPL	Q7Z465	357 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RBM34-208	ENST00000485019	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		13.21	□□□□□ -0.29

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