RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 SCNN1AP37088 669 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC11A2P49281 568 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DGKGP49619 791 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NRLP54845 237 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 MPPE1Q53F39 396 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 C10orf76Q5T2E6 689 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NADSYN1Q6IA69 706 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DDI1Q8WTU0 396 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ACDQ96AP0 544 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.78■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PRRT4C9JH25 899 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 FERP16591 822 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NOS2P35228 1153 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TIE1P35590 1138 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 PBX1P40424 430 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 UBASH3AP57075 661 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZNF445P59923 1031 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 DMC1Q14565 340 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 RFWD3Q6PCD5 774 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 AGPAT1Q99943 283 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 STARD13Q9Y3M8 1113 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MMP8P22894 467 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MATKP42679 507 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FNTBP49356 437 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SGSHP51688 502 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PIK3R6Q5UE93 754 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ALLCQ8N6M5 410 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MSANTD4Q8NCY6 345 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A5Q8TAD4 765 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ADAM33Q9BZ11 813 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TSPY26PQ9H489 355 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FAM204AQ9H8W3 233 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.073e-20■■■■□ 20.1
ACTB-211ENST00000480301 DDIT4Q9NX09 232 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.76■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FANCMQ8IYD8 2048 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 LRRC53A6NM62 1247 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8SH3BPF8 625 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 APOEP02649 317 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CCDC172P0C7W6 258 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 GBP1P32455 592 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MRE11P49959 708 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CENPCQ03188 943 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 RNF43Q68DV7 783 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 LONP2Q86WA8 852 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NT5C3BQ969T7 300 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 MYEOVQ96EZ4 313 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SYT11Q9BT88 431 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.071e-16■■□□□ 13.4
ACTB-211ENST00000480301 PIEZO1Q92508 2521 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 SGK1O00141 431 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ADAM23O75077 832 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FLT3P36888 993 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 PTP4A2Q12974 167 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 FIGNQ5HY92 759 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 BTN2A3PQ96KV6 586 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 HHIPQ96QV1 700 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 NPY6RQ99463 290 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-211ENST00000480301 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms