RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TLCD1	Q96CP7	247 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SERPINB12	Q96P63	405 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	EPAS1	Q99814	870 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	WBP1L	Q9NX94	342 aa		18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CHAD	O15335	359 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	GNGT1	P63211	74 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DDR2	Q16832	855 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	EMC10	Q5UCC4	262 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DGKI	O75912	1065 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM63A	O94886	807 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP5D	P30049	168 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	HCAR3	P49019	387 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DPYS	Q14117	519 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		18.93	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM72C	H0Y354	149 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PBX3	P40426	434 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PDK1	Q15118	436 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM72B	Q86X60	149 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	OLFM3	Q96PB7	478 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SCML2	Q9UQR0	700 aa		18.92	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PQH9	124 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	GCAT	O75600	419 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ERCC2	P18074	760 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	GPR15	P49685	360 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	GAD2	Q05329	585 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	AP1B1	Q10567	949 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SEMA3B	Q13214	749 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	KCNJ11	Q14654	390 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	BBS9	Q3SYG4	887 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	MFSD5	Q6N075	450 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	VPS52	Q8N1B4	723 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CCNY	Q8ND76	341 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	C5orf60	A6NFR6	353 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DCLK1	O15075	740 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	IRAK2	O43187	625 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	PHB	P35232	272 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	DMTN	Q08495	405 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SMARCB1	Q12824	385 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		18.91	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TCEA3	O75764	348 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV3-25	P01717	112 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	FAXC	Q5TGI0	409 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	STKLD1	Q8NE28	680 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	TBX21	Q9UL17	535 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	RAD54B	Q9Y620	910 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	BANF1	O75531	89 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	CLTB	P09497	229 aa		18.9	■□□□□ 0.62
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62

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