RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 ITPR2Q14571 2701 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 A0A1W2PQU0 124 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 WDR27A2RRH5 827 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ENO4A6NNW6 628 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ZNF263O14978 683 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CCNE2O96020 404 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 EGFP01133 1207 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 C8BP07358 591 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PSMC3P17980 439 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RPS6KB1P23443 525 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RDXP35241 583 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SREBF1P36956 1147 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SLC26A2P50443 739 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RIPPLY3P57055 190 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ANAPC15P60006 121 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 LSAMPQ13449 338 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DRP2Q13474 957 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DDR2Q16832 855 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DGKKQ5KSL6 1271 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MROH9Q5TGP6 573 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 LIPIQ6XZB0 460 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GPR155Q7Z3F1 870 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DEFB119Q8N690 84 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 BICD2Q8TD16 824 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RLN3Q8WXF3 142 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PIBF1Q8WXW3 757 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ZMYND12Q9H0C1 365 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 AZI2Q9H6S1 392 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GDE1Q9NZC3 331 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 FNIP2Q9P278 1114 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DPP7Q9UHL4 492 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SNX14Q9Y5W7 946 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 TSC2P49815 1807 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PTPRDP23468 1912 aa4.8□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PLK4O00444 970 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 HBP1O60381 514 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CBFA2T3O75081 653 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SCG5P05408 212 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CYP3A4P08684 503 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 C6P13671 934 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 IFNAR1P17181 557 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GNA11P29992 359 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ADSSP30520 456 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GPC3P51654 580 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ADCY7P51828 1080 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 DGKEP52429 567 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 NAPAP54920 295 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CXADRP78310 365 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 SETQ01105 290 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 EFEMP1Q12805 493 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MTMR1Q13613 665 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CEP55Q53EZ4 464 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 UBXN11Q5T124 520 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 GALNT17Q6IS24 598 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 EFCAB12Q6NXP0 572 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 FUT10Q6P4F1 479 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 Q6ZUG5 572 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 RUFY3Q7L099 469 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 FERMT3Q86UX7 667 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MFSD6LQ8IWD5 586 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CARFQ8N187 725 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 CCDC148Q8NFR7 591 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 HASPINQ8TF76 798 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 KCTD13Q8WZ19 329 aa4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CNN3-204ENST00000461018 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms