RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TMEM51Q9NW97 253 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 OSER1Q9NX31 292 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PPM1AP35813 382 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 HCAR3P49019 387 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 TPI1P60174 286 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FPGSQ05932 587 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.1■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 CCDC25Q86WR0 208 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SERPINB11Q96P15 392 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PLAAQ9Y263 795 aa22.1■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM72CH0Y354 149 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MAP3K6O95382 1288 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FGBP02675 491 aa22.09■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 PSEN1P49768 467 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FAM72BQ86X60 149 aa22.09■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 EPAS1Q99814 870 aa22.09■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 URODP06132 367 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RARGP13631 454 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 ATF6P18850 670 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CCR1P32246 355 aa22.08■■□□□ 1.13
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CTU2-202ENST00000453996 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 MORF4L2Q15014 288 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 LRIG3Q6UXM1 1119 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PCGF5Q86SE9 256 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 BADQ92934 168 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 RTP4Q96DX8 246 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 USP29Q9HBJ7 922 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 AAASQ9NRG9 546 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.08■■□□□ 1.13
CTU2-202ENST00000453996 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 TPGS2Q68CL5 300 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 GJB5O95377 273 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 HAPLN3Q96S86 360 aa22.07■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 SH3GL2Q99962 352 aa22.07■■□□□ 1.12
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CTU2-202ENST00000453996 HACD1B0YJ81 288 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 ABLIM3O94929 683 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 ERCC2P18074 760 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 VPS52Q8N1B4 723 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.06■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 DENND2CQ68D51 928 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 FIBCD1Q8N539 461 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 PAK5Q9P286 719 aa22.05■■□□□ 1.12
CTU2-202ENST00000453996 STK39Q9UEW8 545 aa22.05■■□□□ 1.12
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