RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 POU5F1BQ06416 359 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PNPLA1Q8N8W4 532 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL23Q8NBE8 558 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ARRDC4Q8NCT1 418 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP4R1Q8TF05 950 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MYLK2Q9H1R3 596 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FOCADQ5VW36 1801 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 F8W810 466 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 BUD23O43709 281 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC8A1P32418 973 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 HDAC4P56524 1084 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LILRA4P59901 499 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CCNYL1Q8N7R7 359 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 OR52K1Q8NGK4 314 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CKAP2Q8WWK9 683 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 WDCPQ9H6R7 721 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 C2CD2Q9Y426 696 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 KRT38O76015 456 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 EPHB1P54762 984 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN10P78369 228 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 BTBD8Q5XKL5 378 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM42Q8IWZ5 723 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD11O43934 449 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SOAT2O75908 522 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRP9Q7RTR0 991 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 OSTM1Q86WC4 334 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FITM2Q8N6M3 262 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP2A3Q93084 1043 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LHX5Q9H2C1 402 aa13.99□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MDM4O15151 490 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM189A1O60320 539 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ENDOD1O94919 500 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 OASLQ15646 514 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MAGEB18Q96M61 343 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 YJEFN3A6XGL0 299 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 E7ENQ6 273 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ABLIM1O14639 778 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ALOX15BO15296 676 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TAC1P20366 129 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 RGS2P41220 211 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FLT3LGP49771 235 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 USP4Q13107 963 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 POU6F1Q14863 301 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LONP2Q86WA8 852 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC35B2Q8TB61 432 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MOCOSQ96EN8 888 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CLUHO75153 1309 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 COG7P83436 770 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL13BQ3SXY8 428 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 EFHC1Q5JVL4 640 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC38Q5VT99 294 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF410Q86VK4 478 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SCAMP5Q8TAC9 235 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SERAC1Q96JX3 654 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SNX27Q96L92 541 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SGIP1Q9BQI5 828 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SPON2Q9BUD6 331 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TXLNGYQ9BZA5 131 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 TKTL2Q9H0I9 626 aa13.98□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MYL2P10916 166 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CPB1P15086 417 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD14CQ5VZR4 134 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CMC1Q7Z7K0 106 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 RFWD2Q8NHY2 731 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 BCO2Q9BYV7 579 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 HAUS5O94927 633 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 MT-CO1P00395 513 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX11P35716 441 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 FUKQ8N0W3 1084 aa13.97□□□□□ -0.17
RABGEF1-210ENST00000437078 STMN2Q93045 179 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms