RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 AZIN2Q96A70 460 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 C11orf70Q9BRQ4 267 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NUP58Q9BVL2 599 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 DDIT4Q9NX09 232 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 COX16Q9P0S2 106 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 WDFY4Q6ZS81 3184 aa18.74■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 GFRA2O00451 464 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 APOEP02649 317 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CISD3P0C7P0 127 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SLC6A4P31645 630 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 MATKP42679 507 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NSFP46459 744 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CENPCQ03188 943 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 C10orf76Q5T2E6 689 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NADSYN1Q6IA69 706 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NUDT18Q6ZVK8 323 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 ACDQ96AP0 544 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PHOX2BQ99453 314 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 FBXO10Q9UK96 956 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 STAP1Q9ULZ2 295 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SLC8A2Q9UPR5 921 aa18.73■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 K7ESF4 209 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 M0QYT0 321 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TPM3P06753 285 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TDGF1P13385 188 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TNFAIP3P21580 790 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TIE1P35590 1138 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NBL1P41271 181 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SULT1E1P49888 294 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NME3Q13232 169 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 EMC10Q5UCC4 262 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 RFWD3Q6PCD5 774 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 RNF34Q969K3 372 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NPY6RQ99463 290 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 RRN3Q9NYV6 651 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 ADAM22Q9P0K1 906 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 R4GN57 208 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.72■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 A0A1W2PQJ5 194 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 HOXC13P31276 330 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CCR1P32246 355 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 FLT3P36888 993 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SGSHP51688 502 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PTP4A2Q12974 167 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 DMC1Q14565 340 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PIK3R6Q5UE93 754 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SYT13Q7L8C5 426 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NELL1Q92832 810 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 BTN2A3PQ96KV6 586 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SYT11Q9BT88 431 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 HAUS4Q9H6D7 363 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.71■□□□□ 0.59
HERC3-205ENST00000426683 KCNU1A8MYU2 1149 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 PRRT4C9JH25 899 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 CBFA2T2O43439 604 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 CALB1P05937 261 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 SLC2A3P11169 496 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 ABCB4P21439 1286 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 PRKCIP41743 596 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 NRLP54845 237 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 DMWDQ09019 674 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 RAP1GAP2Q684P5 730 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 TRNP1Q6NT89 227 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 ALLCQ8N6M5 410 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 CPLX3Q8WVH0 158 aa18.7■□□□□ 0.58
HERC3-205ENST00000426683 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
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