RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 CD93Q9NPY3 652 aa16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 RXFP3Q9NSD7 469 aa16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGC3Q9UN70 934 aa16.12■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SPTBN2O15020 2390 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 IGLV3-25P01717 112 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 HLA-FP30511 346 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 TBX4P57082 545 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 LMNB2Q03252 620 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 RING1Q06587 406 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ENPP2Q13822 863 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ADGRF1Q5T601 910 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 RFWD3Q6PCD5 774 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 FAM71AQ8IYT1 594 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 CHPFQ8IZ52 775 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 DDI1Q8WTU0 396 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SLC6A17Q9H1V8 727 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 GON4LQ3T8J9 2241 aa16.11■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 IRAK2O43187 625 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ALDH1A2O94788 518 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 CYBBP04839 570 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NDUFV2P19404 249 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 GBP1P32455 592 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 MPLP40238 635 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 IL12RB1P42701 662 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 KLK7P49862 253 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NNTQ13423 1086 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 KRT31Q15323 416 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 PTPN20Q4JDL3 420 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 MPPE1Q53F39 396 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 BEND5Q7L4P6 421 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SORCS1Q8WY21 1168 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 TCEAL3Q969E4 200 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 GANQ9H2C0 597 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ACSL4O60488 711 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 ERBB2P04626 1255 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 GOLGA1Q92805 767 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 LMLNQ96KR4 655 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SERPINB11Q96P15 392 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 LHX5Q9H2C1 402 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 HSD3B7Q9H2F3 369 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 STON1Q9Y6Q2 735 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 LAMA1P25391 3075 aa16.09■□□□□ 0.17
SPC24-201ENST00000423327 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 EPHB6O15197 1021 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ZNF806P0C7X5 589 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 UCHL3P15374 230 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ARHGAP8P85298 464 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PTK2Q05397 1052 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ZNF234Q14588 700 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ELF2Q15723 593 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 AZIN2Q96A70 460 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.08■□□□□ 0.16
SPC24-201ENST00000423327 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms