RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TFDP3Q5H9I0 405 aa17.56■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATAT1Q5SQI0 421 aa17.56■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 CMTM8Q8IZV2 173 aa17.56■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTRT1Q8TDG2 376 aa17.56■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAPGEF5Q92565 580 aa17.56■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF670Q9BS34 389 aa17.56■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PI4K2BG5E9Z4 385 aa17.54■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF185O15231 689 aa17.54■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LATS1O95835 1130 aa17.54■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CREG2Q8IUH2 290 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 MICALL1Q8N3F8 863 aa17.54■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 EPAS1Q99814 870 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 APOL5Q9BWW9 433 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 GKN1Q9NS71 199 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMPD4Q9NXE4 827 aa17.54■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BRJ5 948 aa17.53■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LTBRP36941 435 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTHFRP42898 656 aa17.53■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA3BQ13214 749 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ITFG1Q8TB96 612 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAIP1Q8WWC4 291 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 TSC1Q92574 1164 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSBPL8Q9BZF1 889 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 L2HGDHQ9H9P8 463 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDP1Q9NUW8 608 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDE1Q9NZC3 331 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF510Q9Y2H8 683 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYH10P35580 1976 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACSL4O60488 711 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 TJP3O95049 919 aa17.53■□□□□ 0.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGGP02679 453 aa17.53■□□□□ 0.4
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